个人介绍:

长期从事系统发育学相关算法与工具的开发。设计并开发了大规模系统发育树构建工具ASTRAL-IV、针对多拷贝基因家族树的建树工具ASTRAL-Pro、针对低解析度基因树的建树工具wASTRAL、基于大规模全基因组比对的建树工具CASTER、低成本建树工具WASTER、古杂交检测工具D*、比对错误检测工具TAPER等算法工具。
GitHub: https://github.com/chaoszhang
Gitee: https://gitee.com/chaos_zhang
Bioconda: https://bioconda.github.io/recipes/aster/README.html

教育经历:

2017年9月 - 2022年9月 生物信息学与系统生物学博士 加州大学圣地亚哥分校
2014年8月 - 2017年6月 生物工程（生物信息学）学士 加州大学圣地亚哥分校
2014年8月 - 2017年6月 数学（计算机科学）学士 加州大学圣地亚哥分校

工作经历:

2024年10月-2025年8月 助理教授 哥本哈根大学
2022年11月-2024年9月 访问学者 加州大学伯克利分校
2022年10月-2024年9月 博士后 哥本哈根大学

      大规模全基因组系统发育树推断、低成本基因组系统发育树构建、跨物种古杂交检测、系统发育网络构建、大规模系统发育分析、大规模全基因组比对、大规模比对纠错、系统发育学理论等。

CASTER: Direct species tree inference from whole-genome alignments
C Zhang, R Nielsen, S Mirarab
Science 387 (6737), eadk9688

ASTER: A Package for Large-Scale Phylogenomic Reconstructions
C Zhang, R Nielsen, S Mirarab
Molecular Biology and Evolution 42 (8), msaf172