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Journal Club | Single-cell Multi-omics Strategies and Applications

Mar.22.2020

Speaker:苏晨鹏 董明泽 王博恩

Time:14:00 - 17:00

摘要:

       近年来,高通量单细胞技术(high-throughput single-cell molecular profiling)的发展在遗传、表观遗传、转录组、蛋白质组和细胞发育等领域的研究产生了巨大的变革,以单细胞转录组测序(scRNA-seq)为代表的单细胞测序使得人们有机会在单细胞水平上对某个具体的生物系统进行整合性的研究,同时也带来了实验上和计算上的巨大挑战。如何对多种模式(Multi-models)、不同技术与样本的数据进行整合成为整合分析的核心问题之一。

       本次JC将专注于以scRNA-seq为中心的多组学数据整合,分别介绍计算上(Stuart et al., 2019)、实验上(Cao et al., 2018)的代表性方法同时辅以其他的计算思路,最后介绍整合分析的具体应用实例(Welch et al., 2019)。

班主任:陶乐天老师

嘉宾:白凡老师(BIOPIC),邢栋老师(BIOPIC),林一瀚老师(北京大学定量生物学中心)